Jднозначный ответ дать невозможно. Dcq pависит от того, что считать мерилом размера - внутреннюю площадь помещений для верующих, общую площадь или размер самого храма.
Помимо Никольской церкви в Рогачёво, могу назвать собор в Новоиерусалимском монастыре. Он, пожалуй, даже поболее будет, если с подземным храмом считать.
Самым большим храмом Московской епархии окажется наверное строящийся Георгиевский собор в Одинцово. В этом случае речь идёт скорее о полезной площади. Собор будет 2-этажный.

Церковь Николая Чудотворца в Рогачево - огромный кирпичный храм в русско-византийском стиле, выстроенный вместо старой каменной церкви рубежа XVII-XVIII вв. попечением купцов Мошкиных и Гордеевых. Четырехстолпная трапезная со Смоленским и Предтеченским приделами построена в 1849-1853, четырехстолпный пятикупольный главный храм сооружен в 1862-1886, колокольня в 1877. Закрыт в 1930-х. Возвращен верующим в 1991 году.
Никольский собор в Рогачёво возведен на обширной торговой площади во второй половине XIX в. тщанием местных богатых предпринимателей - Мошкиных и Гордеевых. Колокольня в четыре яруса окончена в 1877 г. Два эти объёма соединены между собой посредством протяжённой четырёхстолпной трапезной (1853 г.), завершённой массивным, приземистым барабаном с главкой. Холодная церковь Николая Чудотворца представляет собой величественный четырёхстолпный храм, крестово-купольного типа, в лучших традициях "тоновской" архитектуры. Лишённый апсид центрический объём храма опоясан в средней части крупной, включающей арочные окна, аркатурой, и завершён поверх карниза ярусом закомар, отвечающих делению фасадов. Мотив аркатуры повторён на световых барабанах с луковичными главами. Все декоративные элементы здания крупные, масштабные; исключение составляют часовня и крылечки, стилизованные в духе XVII в., и пристроенные в 1880-х гг.