Здравствуйте! Идея хорошая конечно. Смотря на сколько дней приедете в Москву. Да и все музеи обойти за 2-3 дня сложно будет. Тем более, что вы пишите, что с ребенком. Сделал вам маленькую такую подборочку, в какие музеи ну просто обязательно стоит пойти. Вообще-то музеев в Москве очень много. И если у вас есть интернет, то обязательно найдете и еще интересные места.

1. Планетарий
Моско́вский планета́рий — один из самых больших в мире и самый старый планетарий в России. Расположен в Москве возле новой территории Московского зоопарка, недалеко от Садового кольца. В Московском планетарии находится обсерватория, из которой можно наблюдать различные космические объекты.
Место: Садовая-Кудринская улица, дом 5. Ближайшая станция метро — Баррикадная.

2. Третьяковская галерея
Государственная Третьяковская галерея, ГТГ (известна также как Третьяковка) — художественный музей в Москве, основанный в 1856 году купцом Павлом Третьяковым и имеющий одну из самых крупных в мире коллекций русского изобразительного искусства. Экспозиция в главном корпусе «Русская живопись XI — начала XX в».
Место: Лаврушинский переулок 10

3. Исторический музей
Государственный исторический музей (ГИМ) — национальный исторический музей России, расположенный на северной стороне Красной площади в Москве. Также музею принадлежат соседние здания монетного двора и Московской городской думы. Собрание музея отражает историю и культуру России с древнейших времен и до наших дней, является уникальным по численности и содержанию экспонатов.
Место: Красная площадь 1/2

4. Музей изобразительных искусств имени А. С. Пушкина
Госуда́рственный музе́й изобрази́тельных иску́сств и́мени А. С. Пу́шкина (сокращённо ГМИИ им. А. С. Пушкина, бывший «Музей изящных искусств имени императора Александра III при Московском императорском университете») — один из самых крупных и значительных российских музеев европейского и мирового искусства. Открыт 31 мая (13 июня) 1912 года.
Место: ул. Волхонка 12

5. Музей имени М. А. Булгакова в Москве
Государственный музей им. М. А. Булгакова в Москве — первый и единственный в Российской Федерации официальный музей, посвященный жизни и творчеству Михаила Афанасьевича Булгакова.
Место: Большая Садовая д10 кв 50

6. Оружейная палата
Оруже́йная пала́та — московский музей-сокровищница — является частью комплекса Большого Кремлевского дворца.
Основу музейного собрания составили веками хранившиеся в царской казне и патриаршей ризнице драгоценные предметы, выполненные в кремлёвских мастерских, а также полученные в дар от посольств иностранных государств. Своим названием музей обязан одному из древнейших кремлёвских казнохранилищ.
Место: Кремль

7. Центральный дом художника
Центральный дом художника (ЦДХ) — московское выставочное объединение «Центральный дом художника» Международной конфедерации союзов художников, один из самых известных выставочных центров России. В здании ЦДХ также находится, занимая более половины его площади, Государственная картинная галерея (постоянная экспозиция «Искусство XX века») как часть Третьяковской галереи.
Место:Крымский вал 10

Вы не указали возраст ребенка.А то посоветовал бы Дельфинарий на ВДНХ, зоопарк, аквапарки...